2 de enero de 2022

Semana 1, evolucion de la pandemia

Quizás ustedes eran muy jóvenes, pero en Noviembre de 2021 esperabamos que la variante delta fuera responsable de una nueva ola de casos en Argentina, como por entonces lo estaba siendo en varios países de Europa (sobre "la nueva ola") Hasta que ómicron lo cambió todo. Lo está cambiando en Argentina, pero lo está cambiando en cada uno de los 110 países donde ya se ha reportado su presencia. Aunque hablar de porcentajes de incrementos de casos puede hacer perder la magnitud. Solo en Argentina creció un 853% en las últimas dos semanas del año, algo así como que se multiplicó por 16 veces. En España se multiplicó por 10 y en Estados Unidos por 4.67. Más allá de que en Argentina solo en Córdoba se ha confirmado que esta ola es por la variante ómicron, por la rápidez en que se multiplican los contagios es dificil pensar que no sean por la nueva variante en otros lugares (Ciudad de Buenos Aires). Mientras que en países como Sudáfrica continúa bajando el número de casos, algo que también parece suceder en Noruega, donde posiblemente se hayan sucedido más casos en tres semanas que en todas las oleadas anteriores sumadas. 

 


En todos los países donde la variante ómicron entra se observa una curva de casos en forma de J en las últimas 3 semanas. En Argentina esa curva también se ve en 3 provincias (Córdoba, CABA y Buenos Aires).


El número de internaciones aumenta, pero todavía se sigue manteniendo bajo, pero tanto este número como el de la mortalidad, son números que se difieren en el tiempo. La gravedad debe calcularse con los números de casos de al menos 10 días atrás

Y de hecho algunos lo están estimando y se confirma que esta oleada es menos grave. Con la rápidez que se sucede todo lo que se está viendo en la internación son pacientes que se han infectado con las variantes delta y gama, por lo que el menor número de internaciones se debe sin duda a los altos niveles de vacunación. 

En el gráfico se han superpuesto la segunda ola (con variante gama) y esta tercer ola (todavía en internación con variantes delta y gama principalmente). 

Argentina tenía el 1ro. de Mayo de 2021 un 2% de vacunados con dos dosis y un mes después un 6%. vs el 73% de principios de enero de 2022.

 

 

 

 

 

Para los que quieran ver como está Sudáfrica, aquí están las curvas actualizadas y comparada con olas anteriores. Los casos alcanzaron un 112% más que la ola con la variante delta, pero las internaciones fueron un 58% menos y la mortalidad de un 6% que durante la ola anterior. 

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Recordemos que esos números se deben ajustar por otras variables, como nivel de vacunación, algo que ya se hizo por ejemplo en Ontario. (sobre la levedad de esta variante aqui)

Que el número de casos se haya elevado por un breve espacio de tiempo no significa que sea más leve. Solo indica que la población susceptible se agotó rápidamente. Probablemente por la inmunidad que la población tenía previamente. Hoy sabemos que incluso el nivel de anticuerpos estaba elevado en un 68% de los sudafricanos que no se habian vacunado y la hipótesis de que la nueva variante se había dado por las bajas tasas de vacunación trocó en que se pudo haber dado por la gran cantidad de inmunodeprimidos (pacientes con VIH).

 


Y algo parecido se puede ver en Madrid.

 

 

 

 

 

 


👈 O en Londres

 

 

 

 

 

Veamos la mortalidad


Supongo que a esta altura el gráfico exime de cualquier comentario acerca de la efectividad de las vacunas. Un año atras, para esta época, solo en Reino Unido la gente moría 11.7 veces más.

Vacunación

Tercera dosis

Se incrementó el número aplicado en los últimos días. Aunque todavía lejos de más del 50% que ostenta Chile.
 

 

 

 

 

Si bien las tasas de vacunaciones son altas, no lo son cuando se consideran por grupos de edad.  Más de 2.3 millones de niños entre 3 y 11 años no han recibido aún su primer dosis. 

En algunos países, como Estados Unidos, se reporta una gran cantidad de internaciones en este grupo. Aunque algunos advierten que se trata de pacientes que se internaron por otras causas y se registra un test positivo. Nadie está aclarando este punto.



Y este gráfico, o alguno que se le parezca, será mostrado alguna vez en el futuro, a estudiantes de epidemiología. En el se compara a la variante ómicron con el sarampión. Si bien la nueva variante parece tener una tasa de reproducción de 6 contra la tasa de reproducción del sarampión que está estimada en 18, la menor cantidad de días de incubación hacen que se disemine más rápidamente. Aun más que el virus salvaje de Wuhan de hace 2 años. Por lo que el número de contagios es elevado y se producen antes en el tiempo. Por supuesto que es una estimación, ya que afortunadamente y gracias a otras vacunas, no tenemos sarampión. Según la estimación en 12 días desde el contagio se producen 15 casos de sarampión, pero 216 casos de covid.

En esta primer semana del año no se espera otra cosa que ver como los casos se incrementan. La saturación de servicios de atención médica ya se ve en algunos lugares, pero es más marcada la saturación de los centros de testeo. Los tests rápidos de antígenos pudieran ser de gran ayuda para descentralizar y aliviar esta tensión, o incluso en contacto estrecho con síntomas, si estos son leves no aportan mucho más al diagnóstico. En un paciente con síntomas y en momentos de gran circulación viral, como es este, la probabilidad de que si el test es positivo la persona tenga la enfermedad es tan alta como el 98%, y aunque 43 de cada 1.000 tests pueden ser falsos negativos, seguramente creerle siempre al test parece otorgar más ventaja. Distinto puede ser en asintomáticos, pero aún en este grupo el valor predictivo positivo de un test de antígeno también excede el 98%, pero 10 de cada 100 pacientes pueden tener un falso negativo. 

La provisión de tests para que la misma gente se autodetecte es algo que se hace en Reino Unido, Estados Unidos y Europa. Nadie ha planteado en esos países que la gente no sabe como hacerlo o que es "peligroso", o que se va a perder la trazabilidad o el seguimiento epidemiológico, tal como se está planteando en Argentina. Seguramente más impulsado por intereses económicos que por facilitarle las cosas a la gente. (comunicado de los bioquímicos) Desde los diferentes gobiernos debiera tenerse esto en cuenta, ya que no se puede sostener la gestión de los tests de la misma manera en que se hacía hace 6 meses atrás. Ni siquiera hace un mes atrás, si algo tiene esta crisis es que es algo dinámico, y no dejamos de aprender. Bueno, de esto último algunos, no todos. 

Artículos relacionados

Lecturas

1. Un estudio en Ontario revela que dos dosis previenen la infección por la variante ómicron en un 37% y que tres dosis aumentan la prevención al 93%, en: Effectiveness of COVID-19 vaccines against Omicron or Delta infection. Sarah A Buchan, Hannah Chung, Kevin A Brown, Peter C Austin, Deshayne B Fell, Jonathan Gubbay, Sharifa Nasreen, Kevin L Schwartz, Maria E Sundaram, Mina Tadrous, Kumanan Wilson, Sarah E Wilson, Jeff Kwong.

From Delta to Omicron: analysing the SARS-CoV-2 epidemic in France using variant-specific screening tests (September 1 to December 18, 2021). Mircea T. Sofonea, Benedicte Roquebert, Vincent Foulongne, Laura Verdurme, Sabine Trombert-Paolantoni, Mathilde Roussel, Stephanie Haim-Boukobza, Samuel Alizon.

Early signals of significantly increased vaccine breakthrough, decreased hospitalization rates, and less severe disease in patients with COVID-19 caused by the Omicron variant of SARS-CoV-2 in Houston, Texas. Paul A Christensen, Randall James Olsen, Scott Wesley Long, Richard Snehal, James J Davis, Matthew Ojeda Saavedra, Kristina Reppond, Madison N Shyer, Jessica Cambric, Ryan Gadd, Rashi M Thakur, Akanksha Batajoo, Regan Mangham, Sindy Pena, Trina Trinh, Jacob C Kinskey, Guy Williams, Robert Olson, Jimmy Golihar, James M Musser.

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