29 de octubre de 2021

Variante delta y vacunacion

El virus "salvaje" que apareció en Wuhan en Noviembre de 2019, fue reemplazado por otras variantes durante el curso de 2020, en Octubre de ese año apareció la variante alfa, en Reino Unido, que tres meses después se haría dominante (22), y la variante omega (Manaos) impulsora de la segunda ola en Argentina, a partir de Abril de este año, entre otras. La variante delta hizo su aparición en Octubre de 2020, pero se hizo  temida al provocar una gran mortalidad en la India en Mayo de este año, para luego al extenderse a más de 180 países en la actualidad.

Aunque existen cerca de 5 mil variantes, la preocupación sobre algunas de ellas surgió  con la inquietud sobre la mayor contagiosidad y si se mantenía la inmunidad cruzada para las distintas variantes con las vacunas pandémicas. Algo relevante de conocer ya que las actuales vacunas actuales habían realizado sus ensayos clínicos de fase 3 antes de que la variante delta se hiciera dominante, en el curso de este año. Hoy representa más del 90% de los casos en Chile y casi el 100% en paises también cercanos como Brasil. Asi como casi todos los casos en paises Europeos y Norteamérica.
En casi todos los paises en donde la variante delta se hace dominante se observa un aumento sostenido de los casos, que no necesariamente impacta en los casos graves o la mortalidad. En Reino Unido el número de casos se está incrementando hoy, a expensas de grupos menos vacunados como los menores de 18 años. Muchos adjudican este hecho a una decisión tardía del gobierno británico en vacunar a este grupo. (20)

Hasta la fecha se ha demostrado ampliamente que esta variante es mucho más contagiosa, pero no se ha demostrado que conlleve una mayor gravedad que otras variantes. (23)
Aún así se han visto hasta tres veces más complicaciones en embarazadas con esta variante. (2) 

En otro estudio publicado en The Lancet Infectious Disease se observó que la probabilidad de internaciones se duplica con la variante delta en relación a la alfa (10)

Un estudio inglés habia establecido que las vacunas no disminuian la carga viral en esta variante, aunque si lo hacian para la variante alfa. (3,4,5,19) Y de hecho la transmisibilidad en convivientes no parece ser afectada luego de dos a tres meses de completar la vacunación, según un estudio reciente publicado a fin de Octubre en The Lancet Infectious Disease (24). Aun asi la disminución de la transmisión es significativa en relación a los no vacunados oscilando entre un 25% y el 75% en los distintos estudios La relevancia en la práctica es que esto implica que el estar vacunado reduce pero no elimina el riesgo de contagiar.
La variante delta es capaz de transmitirse a partir del 6to. dia del contagio, y podria ser asintomatica hasta 2 dias antes de aparecer los síntomas, lo cual crearia una ventana de tiempo en que el virus se disemina en la población en forma independiente a que la persona esté vacunado o no.
En Julio el New England Journal of Medicine publicaba el primer gran estudio "de la vida real" estudiando a más de 19 mil personas en Reino Unido, sobre el impacto de la vacunación para dos variantes la alfa y la delta; que no halló diferencias según el tipo de vacuna, pero si se vio mayor efectividad al aplicar dos dosis que una, tanto para la variante alfa como para la delta. 

Este era el primer estudio de efectividad y a gran escala, que vinculaba a esta variante y a la vacunación. 
Allí se evaluaron las vacunas de Pfizer y AstraZeneca, y en Agosto se sumaria otro estudio en San Petersburgo que evaluaba a la vacuna Sputnik V con idénticos resultados (14). Hoy ya sabemos que todas las vacunas están logrando los mismos resultados.
Esto pudo ser confirmado en la misma población, según una publicación del 20 de Octubre de 2021, también en el New England. (15) Confirmándose también la efectividad  para adolescentes y en esta variante, en un estudio israelí. (16)

Hoy sabemos que la efectividad para disminuir la infección es mucho menor que lo que se habia encontrado con la variante alfa, que era de hasta un 81% (3,4,18). 
En un reporte de Kaiser Permante, el provedor privado más grande de Estados Unidos, ha demostrado que las vacunas tienen una menor efectividad frente a la variante delta, en cuanto a disminuir el número de casos, pero se mantienen muy efectivas frente a los riesgos de enfermar gravemente o morir, en Octubre de 2021. Este estudio fue comentado también en otros lugares. (11)

Para ser más claro, las vacunas todavia pueden prevenir la infección, o riesgo de enfermarse con Covid-19, pero esa efectividad está disminuida en relación a los primeros estudios. Aunque en algunos casos como en una cárcel de California logró evitar la infección sintomática hasta en un 85% de los reclusos, o en otro estudio de la administración de veteranos, en Estados Unidos, sobre 560 mil personas se contagió el 16% en no vacunados y entre un 4% a 9% entre los vacunados. 

En la práctica se puede estimar la efectividad de las vacunas en algunos paises si sabemos en que momento la variante delta se hizo dominante. Esto sucedió en Abril en Israel, en Mayo en Reino Unido y a mediados de Junio en Estados Unidos. En Argentina podria ya decirse que en la última semana de Octubre.
Finalmente un metanálisis, un tipo de estudios que suele aportar evidencias más sólidas que el de un solo estudio clínico, recolectó toda información sobre 17 estudios clínicos, entre Enero y Agosto y reportó que en comparación con la variante alfa, las vacunas habian tenido una disminución de la efectividad para contagiarse de Covid de un 37%, de un 24% para casos sintomáticos y de un 9% para casos graves. Por ello se hace necesaria la vacunación con dosis adicional en algunos grupos.

Es decir que aún mantienen más de un 90% de su efectividad para disminuir los casos graves y disminuir la mortalidad con esta variante.
En un gráfico que muestra la serie de internaciones entre Febrero y Julio de 2021 se observó una diferencia entre vacunados y no vacunados que se mantiene aún después de que la variante delta se convirtiera en la dominante en Estados Unidos (8,9). Aún para Septiembre esta diferencia es relevante, según informa el CDC, los no vacunados pueden tener hasta 18 veces más internaciones. (la linea verde abajo representa a los vacunados).
 
 
 
 
A fines de Octubre en Argentina  la variante representa un 40% de todos los casos y en algunos centros urbanos ha superado al 50% de los casos, mientras que el número de vacunados completos llego al 87% de los mayores de 50 y 75% de los mayores de 18 años. Hasta un 85% de los nuevos casos, en Buenos Aires y alrededores se deben a esta variante según un informe de Proyecto PAIS. Esto sucede en un contexto de una desescalada en dónde se abandonan medidas no farmacológicas que han demostrado efectividad. Argentina enfrenta a esta variante con el 56% de su población vacunada, poco menos de lo que tenia Israel cuando hizo su aparición en Abril, como vemos en la gráfica. Por entonces ese pais relajó sus restricciones, que debió reinstalar luego tras el avance de la variante y algo parecido está sucediendo en Chile ahora.  Lo esperable, es que el número de casos se incremente debido a esta variante, tal como sucede en casi toda Europa, Chile, Uruguay y aún Islandia, pero que el mismo no se acompañe de un aumento en los casos graves ni la mortalidad. Se está observando también un incremento de la mortalidad en paises con tasas de vacunación baja, como Rusia, Ucrania o Rumania. Pero lo deseable es que tampoco se incremente el número de infecciones. Más infecciones no serian buenas noticias ya que una importante proporción de pacientes padecen secuelas tras haber padecido la infección (long covid o covid prolongado), y además hay personas que todavia no han completado su esquema de vacunación (el 25% de los mayores de 18 años), la mitad de los adolescentes en Argentina, y hay grupos donde la eficacia está comprometida (como inmunodeprimidos o mayores de 65 años)

Con estas cifras de población no vacunada, todavia es posible saturar ampliamente los servicios de salud que apenas se están recuperando de la segunda ola. Por lo que hablar en tiempo pasado de la pandemia no solo es aventurado, sino hasta peligroso al crear una falsa sensación de seguridad.  

Argentina ha sido exitosa en demorar la llegada de esta variante, pero la magnitud de la desescalada, pudiera acelerar lo que ya se está viendo y es una elevación del número de casos, que solo en las últimas dos semanas tuvo un incremento del 48%.

La vacunación sin medidas no farmacológicas que lo acompañen no parece ser ni la única respuesta ni la medida más efectiva para disminuir por si sola la infección, en épocas de alta transmisibilidad, esa es la experiencia aprendida de otros paises. En caso que quisiéramos aprender algo de otros paises.

Referencias:
1. Primer estudio de efectividad en variante delta: Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, Gallagher E, Simmons R, Thelwall S, Stowe J, Tessier E, Groves N, Dabrera G, Myers R, Campbell CNJ, Amirthalingam G, Edmunds M, Zambon M, Brown KE, Hopkins S, Chand M, Ramsay M. Effectiveness of Covid-19 Vaccines against the B.1.617.2 (Delta) Variant. N Engl J Med. 2021 Aug 12;385(7):585-594. doi: 10.1056/NEJMoa2108891. Epub 2021 Jul 21. PMID: 34289274; PMCID: PMC8314739. [Pubmed][Texto completo]
2.  Resultados perinatales de la infección grave con variante delta: Seasely, Angela R. MD, et al; on behalf of the CWRH COVID-19 Working Group Maternal and Perinatal Outcomes Associated With the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Delta (B.1.617.2) Variant, Obstetrics & Gynecology: September 30, 2021 - Volume - Issue - 10.1097/AOG.0000000000004607 doi: 10.1097/AOG.0000000000004607
3. Impact of BNT162b2 vaccination and isolation on SARS-CoV-2 transmission in Israeli households: an observational study. Maylis Layan, Mayan Gilboa, Tal Gonen, Miki Goldenfeld, Lilac Meltzer, Alessio Andronico, Nathanaël Hozé, Simon Cauchemez, Gili Regev-Yochay.4. Vaccination with BNT162b2 reduces transmission of SARS-CoV-2 to household contacts in Israel. Ottavia Prunas, Joshua L. Warren, Forrest W. Crawford, Sivan Gazit, Tal Patalon, Daniel M. Weinberger, Virginia E. Pitzer 5. Estudio de carga viral para variantes alfa y delta, vacunados vs. no vacunados, donde no varía la carga viral en vacunados. Luo CH, Morris CP, Sachithanandham J, Amadi A, Gaston D, Li M, Swanson NJ, Schwartz M, Klein EY, Pekosz A, Mostafa HH. Infection with the SARS-CoV-2 Delta Variant is Associated with Higher Infectious Virus Loads Compared to the Alpha Variant in both Unvaccinated and Vaccinated Individuals. medRxiv [Preprint]. 2021 Aug 20:2021.08.15.21262077. doi: 10.1101/2021.08.15.21262077. PMID: 34462756; PMCID: PMC8404894. [medRxiv]
6. He S, Chung Het al. Effectiveness of covid-19 vaccines against variants of concern, Canada. Medrxiv2021.06.28.21259420 [Preprint]. 2021 doi:10.1101/2021.06.28.21259420. Abstract/FREE Full Text
7.  Pouwels, K. B. et al. Preprint at Univ. Oxford https://www.ndm.ox.ac.uk/files/coronavirus/covid-19-infection-survey/finalfinalcombinedve20210816.pdf
8. 12. Citado también por el BMJ el 20 de Agosto
13. Reis BY, Barda N, Leshchinsky M, Kepten E, Hernán MA, Lipsitch M, Dagan N, Balicer RD. Effectiveness of BNT162b2 Vaccine against Delta Variant in Adolescents. N Engl J Med. 2021 Oct 20. doi: 10.1056/NEJMc2114290. Epub ahead of print. PMID: 34670036. [Pubmed
14. Vaccine Effectiveness against Referral to Hospital and Severe Lung Injury Associated with COVID-19: A Population-based Case-control Study in St. Petersburg, Russia.Anton Barchuk, Mikhail Cherkashin, Anna Bulina, Natalia Berezina, Tatyana Rakova, Darya Kuplevatskaya, Oksana Stanevich, Dmitriy Skougarevskiy, Artemiy Okhotin





20. REACT-1 study round 14: High and increasing prevalence of SARS-CoV-2 infection among school-aged children during September 2021 and vaccine effectiveness against infection in England. Marc Chadeau-Hyam, Haowei Wang, Oliver Eales, David J Haw, Barbara Bodinier, Matthew Whitaker, Caroline E Walters, Kylie E. C. Ainslie, Christina J Atchison, Claudio Fronterre, Peter J Diggle, Andrew Page, Alex Trotter, Deborah Ashby, Wendy Barclay, Graham P Taylor, Graham Cooke, Helen Ward, Ara Darzi, Steven Riley, Christl A. Donnelly, Paul Elliott

22. Grint DJ, Wing K, Houlihan C, Gibbs HP, Evans SJW, Williamson E, McDonald HI, Bhaskaran K, Evans D, Walker AJ, Hickman G, Nightingale E, Schultze A, Rentsch CT, Bates C, Cockburn J, Curtis HJ, Morton CE, Bacon S, Davy S, Wong AYS, Mehrkar A, Tomlinson L, Douglas IJ, Mathur R, MacKenna B, Ingelsby P, Croker R, Parry J, Hester F, Harper S, DeVito NJ, Hulme W, Tazare J, Smeeth L, Goldacre B, Eggo RM. Severity of SARS-CoV-2 alpha variant (B.1.1.7) in England. Clin Infect Dis. 2021 Sep 6:ciab754. doi: 10.1093/cid/ciab754. Epub ahead of print. PMID: 34487522; PMCID: PMC8522415. [Pubmed]
23. Taylor CA, Patel K, Pham H, et al. Severity of Disease Among Adults Hospitalized with Laboratory-Confirmed COVID-19 Before and During the Period of SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) Predominance — COVID-NET, 14 States, January–August 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2021;70:1513–1519. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7043e1
24. Community transmission and viral load kinetics of the SARS-CoV-2 delta (B.1.617.2) variant in vaccinated and unvaccinated individuals in the UK: a prospective, longitudinal, cohort study. Anika Singanayagam, Seran Hakki, Jake Dunning, Kieran J Madon, Michael A Crone, Aleksandra Koy. Lancet Infectious Disease.  https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00648-4  [Texto completo]
25. Baden LR, El Sahly HM, Essink B, Follmann D, Neuzil KM, August A, Clouting H, Fortier G, Deng W, Han S, Zhao X, Leav B, Talarico C, Girard B, Paila YD, Tomassini JE, Schödel F, Pajon R, Zhou H, Das R, Miller J. Phase 3 Trial of mRNA-1273 during the Delta-Variant Surge. N Engl J Med. 2021 Nov 3. doi: 10.1056/NEJMc2115597. Epub ahead of print. PMID: 34731553. [Pubmed]
16. Delta en Argentina, desacopladas muertes y casos a Diciembre de 2021
17. Las pacientes embarazadas e infectadas con variante delta,  tienen 14 veces más riesgo de internarse en UCI y 9.56 veces más de necesidad de óxigeno suplementario: Zayet S, Gendrin V, Gay C, Selles P, Klopfenstein T. Increased COVID-19 severity among pregnant patients infected with SARS-CoV-2 Delta variant, France. Emerg Infect Dis. 2022 May [19 de febrero 2022]. https://doi.org/10.3201/eid2805.212080
18. Estudio de efectividad en la India del 61% con dos dosis de la vacuna Covishield para prevenir la infección. Effectiveness of ChAdOx1 nCoV-19 Corona Virus Vaccine (CovishieldTM) in preventing SARS-CoV2 infection, Chennai, Tamil Nadu, India, 2021. Sharan Murali, Manikandanesan Sakthivel, Kamaraj P, Vettrichelvan Venkataswamy, Jeromie Wesley Vivian Thangaraj, Anita Shete, Alby John, Jaganathan Arjun, Girish Kumar C P, Pragya D Yadav, Rima Sahay, Triparna Majumdar, Manisha Dhudhmal, Azhagendran Sivalingam, Sudha Rani D, Augustine D, Vijayaprabha R, Murali Mohan M, Suresh A, Punita M, Elavarasu G, Prabhakaran C, Dhana Priya Vadhani S, Prakash M, Ezhil P, Ganeshkumar Parasuraman, Jagadeesan M, Manish Singh Narnaware, Gagandeep Singh Bedi, Prabhdeep Kaur, Manoj V Murekhar

Twohig KA, Nyberg T, Zaidi A, Thelwall S, Sinnathamby MA, Aliabadi S, Seaman SR, Harris RJ, Hope R, Lopez-Bernal J, Gallagher E, Charlett A, De Angelis D, Presanis AM, Dabrera G; COVID-19 Genomics UK (COG-UK) consortium. Hospital admission and emergency care attendance risk for SARS-CoV-2 delta (B.1.617.2) compared with alpha (B.1.1.7) variants of concern: a cohort study. Lancet Infect Dis. 2021 Aug 27:S1473-3099(21)00475-8. doi: 10.1016/S1473-3099(21)00475-8. Epub ahead of print. PMID: 34461056; PMCID: PMC8397301.
 
11. Sara Y Tartof, Jeff M Slezak, Heidi Fischer, et al. Effectiveness of mRNA BNT162b2 COVID-19 vaccine up to 6 months in a large integrated health system in the USA: a retrospective cohort study. Lancet,October 04, 2021 DOI: 10.1016/S0140-6736(21)02183-8

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